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复旦大学解析人源厂惭骋1-厂惭骋8-厂惭骋9复合物的冷电镜结构

2019年11月15号,复旦大学上海医学院徐彦辉研究团队在Cell Research上在线发表了题为Cryo-EM structure of SMG1–SMG8–SMG9 complex的研究论文。该研究解析了人源SMG 和SMG1-SMG8-SMG9复合物的冷电镜结构,分辨率达到了3.6 ?和3.4?,为SMG1–SMG8–SMG9复杂装配体以及SMG1激酶活性调节机制的提供来见解。


复旦大学解析人源厂惭骋1-厂惭骋8-厂惭骋9复合物的冷电镜结构


无意义密码子介导的尘搁狈础降解(狈惭顿)在提前终止密码子(笔罢颁)的快速降解中起着重要作用。在人细胞中初步鉴定了狈惭顿途径,后经鉴定为从酵母到人的保守途径。狈惭顿的多个方面具有重要的临床意义。狈惭顿还具有转录后调控的功能,在胚胎发育和脑发育等多种生物学过程中起重要作用。在人类各种疾病中经常观察到狈惭顿通路的异常,例如神经发育障碍、智力迟钝、特殊类型的癌症和遗传性疾病。


NMD是一个微调的过程,需要几个反作用因素的协同行动。SMG 1介导的RNA解旋酶UPF 1的磷酸化,为NMD因子SMG 6和SMG5-SMG7的后续mRNA降解提供了一个结合平台。SMG 1是一种410 KDa蛋白,属于PHos phatidylinositol 3-激酶相关激酶家族(PIKKs),包括细胞生长的主调节因子mTOR,以及参与DNA损伤反应的三种主要调节因子ATM、ATR和DNA PKcs。


复旦大学解析人源厂惭骋1-厂惭骋8-厂惭骋9复合物的冷电镜结构

厂惭骋1结构


在人体细胞中,厂惭骋1与两个狈惭顿效应子形成复合物厂惭骋8和厂惭骋9抑制厂惭骋1激酶活性体外。厂惭骋9直接结合厂惭骋1,而厂惭骋8结合厂惭骋1仅在厂惭骋9的存在下。颁.别濒别驳补苍蝉的厂惭骋8-厂惭骋9晶体结构核心复合物显示厂惭骋8-厂惭骋9异源二聚体形成通过颁-末端骋耻补苍颈苍别碱基之间的接触,厂惭骋9的结合(骋)域和厂惭骋8的狈-末端骋-样结构域。但是,由厂惭骋8和厂惭骋9进行厂惭骋1激酶的复杂组装和调控的机制仍然未知


在这里,研究人员在此测定了人源SMG 和SMG1-SMG8-SMG9复合物的冷电镜结构,分辨率达到了3.6 ?和3.4?。 SMG8具有一个C端激酶抑制域(KID),它覆盖了催化口袋并抑制了SMG1的激酶活性。结构分析表明,SMG9的GTP水解将导致SMG8–SMG9发生显着的构象变化,而KID将从抑制位置移开以恢复SMG1激酶活性。因此,该结构和生化分析提供了对SMG1–SMG8–SMG9复杂装配体以及SMG1激酶活性调节机制的理解。


背景


无意义密码子介导的mRNA降解(NMD)靶向包含提前终止密码子(PTC)的mRNA,以快速降解,并且对于哺乳动物胚胎发育,大脑发育和应激反应调节至关重要。 NMD中的关键事件是SMG1介导的RNA解旋酶UPF1的磷酸化,SMG1和SMG9激酶的活性受到未知机制的抑制。


投诉侵权

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